自2016年1月31日两端始发站起，以下旅客列车开行方案进行调整：
上海——乌鲁木齐南Z40/1Z42/39次、济南——乌鲁木齐南Z105/6次、广州——乌鲁木齐南Z138/5Z136/7次、重庆北——乌鲁木齐南K542/3K544/1次、成都——乌鲁木齐南K2058/9K2060/57次、连云港东——乌鲁木齐南K1354/1K1352/3次【春运节前调整为南京（徐州）——乌鲁木齐南K1354/1K1352次】，在兰州西——嘉峪关间由兰新客专线改经由兰新线运行。
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